序號(hào) | 保護(hù)區(qū)類別及面積（平方公里） | 自然保護(hù)區(qū)名稱 | 所在地區(qū) | 主要保護(hù) 對(duì)象 | 面積（平方公里） | 保護(hù)區(qū)級(jí)別 | 批準(zhǔn)機(jī)關(guān) | 批準(zhǔn)時(shí)間（年月） | 主管 部門(mén) | 管理機(jī)構(gòu) |
| 1 | 自然保護(hù)區(qū)（0.003） | 雨花臺(tái)礫礫石層保護(hù)區(qū) | 雨花臺(tái)區(qū) | 礫礫石層地質(zhì)剖面 | 0.003 | 市級(jí) | 市政府 | 1984.12 | 市國(guó)土局 | |
| 2 | 風(fēng)景名勝區(qū)（495.92） | 鐘山風(fēng)景名勝區(qū) | 玄武區(qū) | 山林和人文景觀歷史遺跡 | 35.04 | 國(guó)家級(jí) | 國(guó)務(wù)院 | 1981.11 | 中山陵園管理局 | |
| 3 | 雨花臺(tái)風(fēng)景名勝區(qū) | 雨花臺(tái)區(qū) | 自然和人文景觀 | 1.13 | 省級(jí) | 省政府 | 1997.12 | 雨花臺(tái)陵園管理局 | ||
| 4 | 湯山溫泉-陽(yáng)山碑材風(fēng)景名勝區(qū) | 江寧區(qū) | 地下溫泉、歷史遺跡 | 72.00 | 市級(jí) | 市政府 | 1999.12 | 市建委 | ||
| 5 | 棲霞山風(fēng)景名勝區(qū) | 棲霞區(qū) | 自然和人文景觀 | 8.60 | 市級(jí) | 市政府 | 1999.12 | 市園林局 | 棲霞山公園管理處 | |
| 6 | 幕府山-燕子磯風(fēng)景名勝區(qū) | 南京市區(qū) | 自然風(fēng)貌和人文景觀 | 7.08 | 市級(jí) | 市政府 | 2001.09 | 市園林局 | ||
| 7 | 固城湖風(fēng)景名勝區(qū) | 高淳縣 | 水資源、濕地 | 30.95 | 市級(jí) | 市政府 | 1999.12 | 市建委 | ||
| 8 | 石臼湖風(fēng)景名勝區(qū) | 溧水縣 | 水資源、濕地 | 157.07 | 市級(jí) | 市政府 | 1999.12 | 市建委 | ||
| 9 | 東廬山風(fēng)景名勝區(qū) | 溧水縣 | 自然山林、水庫(kù) | 109.38 | 市級(jí) | 市政府 | 1999.12 | 市建委 | 縣水利局、農(nóng)林局 | |
| 10 | 竹鎮(zhèn)林場(chǎng)風(fēng)景區(qū) | 六合區(qū) | 自然山林 | 6.67 | 市級(jí) | 市政府 | 1999.12 | 市建委 | 竹鎮(zhèn)林場(chǎng) | |
| 11 | 桂子山-金牛水庫(kù)風(fēng)景區(qū) | 六合區(qū) | 自然景觀、水庫(kù) | 68.00 | 市級(jí) | 市政府 | 1999.12 | 市建委 | ||
| 12 | 森林公園（89.62） | 老山國(guó)家森林公園 | 浦口區(qū) | 森林和自然景觀 | 80.00 | 國(guó)家級(jí) | 林業(yè)部 | 1991.08 | 市農(nóng)林局 | 老山林場(chǎng) |
| 13 | 牛首山森林公園 | 江寧區(qū) | 森林和自然景觀 | 6.67 | 省級(jí) | 省農(nóng)林廳 | 1995.08 | 省農(nóng)林廳 | 東善橋林場(chǎng) | |
| 14 | 無(wú)想寺森林公園 | 溧水縣 | 森林和自然景觀 | 2.95 | 市級(jí) | 市農(nóng)林局 | 1992.10 | 縣農(nóng)林局 | ||
| 15 | 飲用水源保護(hù)區(qū)（0.04） | 長(zhǎng)江飲用水源一級(jí)保護(hù)區(qū) | 南京市區(qū) | 飲用水源 | 0.04 | 市級(jí) | 市政府 | 1991.07 | 市水利局市環(huán)保局 | 市市政公用局 |
| 16 | 其它（10.74） | 南京明城墻風(fēng)光帶 | 南京市區(qū) | 明城墻遺跡 | 6.51 | 市級(jí) | 市政府 | 1999.03 | 市規(guī)劃局 | |
| 17 | 城市公園 | 南京市區(qū) | 綠地、景觀 | 4.23 | 市級(jí) | 市政府 | 1992.08 | 市園林局 | ||
| 全市自然保護(hù)區(qū)總面積：596.323(平方公里) | ||||||||||
| 全市自然保護(hù)區(qū)覆蓋率：9.04% | ||||||||||
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